荧光显微镜能够观察到特异性蛋白分子的原理是什么?某些物质经一定波长的光照射后,物质中的分子被激活,吸收能量后跃迁至激发态,当其从激发态返回基态时,所吸收的能量除部分转化为热量或用于光反应外,其余较大部分则以光能形式辐射出来,由于能量没能全以光的形式辐射出来,故所辐射出的光的波长比激发光的要长,这种波长长于激发光的可见光部就是荧光,所谓荧光就是某些物质在一定波长光的照射下,在很短时间内所发出的比照射光波长更长的可见光。
荧光显微镜与普通光学显微镜不同,它不是通过普通光源的照明观察标本,而是利用一定波长的光(通常是紫外光、蓝紫光)激发显微镜下标本内的荧光物质,使之发射荧光,所以,荧光显微镜的光源所起的作用不是直接照明,而是作为一种激发标本的内荧光物质的能源。我们之所以能观察标本,不是由于光源的照明,而是标本内荧光物质吸收激发的光能后所呈现的荧光现象。